• 熱線電話:010-56107385

聯系方式

地 址:北京市昌平區北清路生命科學園博雅CC -9號樓2層
電 話:010-56107385
傳 真:
郵 箱:support@ori-gene.cn

MicroRNA測序

您現在的位置:首頁 > 科研服務 > RNA領域 > MicroRNA測序

MicroRNA測序

產品描述信息

         microRNAmiRNA)是一類內生的、長度約為20-24個核苷酸的小RNA,其在細胞內具有多種重要的調節作用。每個miRNA可以有多個靶基因,而幾個miRNA也可以調節同一個基因,這種復雜的調節網絡既可以通過一個miRNA來調控多個基因的表達,也可以通過幾個miRNA的組合來精細調控某個基因的表達。大量的研究結果表明,miRNA在正常發育過程以及疾病發生過程中具有重要的作用,在診斷和治療領域具有廣闊的應用前景。然而目前對于miRNA的研究方法主要是通過實時定量PCR以及基因芯片技術,而且重點關注的是其表達與定量,并僅僅局限于研究那些序列信息或二級莖環結構信息已知的miRNA,而無法尋找和發現新的miRNA
      基于Illumina高通量測序平臺的miRNA測序技術突破了現階段研究技術手段上的局限性,不但可以檢測miRNA表達差異,而且可以研究其3’異質性,眾多的isomiR(miRNA異構體)以及未發現的新的miRNA為更加靈活、深入研究miRNA提供了解決方案。

產品詳細信息

1、高通量,低成本:一次測序可得到數百萬條序列,單次運行可經濟分析多個樣品;

2、高分辨率:基于高通量測序技術能夠直接從單核苷酸水平研究小分子RNA,不存在傳統芯片雜交的熒光模擬信號帶來的交叉和背景噪音問題,非常有利于區分相同家族以及序列極為相似的不同sRNA

3、高精準度:reads能覆蓋sRNA全序列,可成功檢測低豐度表達的miRNA

4、通用平臺,不依賴已知信息:可進行任何物種的sRNA序列測定,既能鑒定已知的miRNA,又能預測新的miRNA

5、可重復性高:深度測序保證了抽樣隨機性,重復性非常好,無需重復實驗

1、樣品類型:完整且無污染的總RNA

2、樣品需求量(單次):≥10 μg

3、樣品濃度:≥200 ng/μL

4、樣品純度:OD260/280 =1.8~2.2OD260/230≥2.028S:18S≥1.5RIN≥8.0;23S:16S≥1.5 (此項要求只針對原核生物)。

【案例一】:采用新一代測序技術分析浸水24小時后的玉米種子的小RNA文庫,進一步分析確認了115個已知miRNA屬于24miRNA家族,并發現了167個新的玉米miRNA。使用同樣的方法,再次建立小RNA文庫,將獲得的已知miRNA和新發現miRNA的信息與重新構建的小RNA文庫進行比對,成功推測出106個新miRNA的候選靶標。研究結果顯示:玉米浸水種子中存在著miRNA媒介的基因表達調控。

圖1 小RNA差異表達分布圖

圖2 定量RT-PCR驗證靶基因表達水平

圖3 小RNA調控網絡分析

 【案例二】:經過microRNA測序和生物信息數據分析,成功檢測出不同條件下動植物(人、果蠅、土豆等)miRNA的表達差異,從而揭示了miRNA在基因調控等方面的作用機制。

[1]Li D, Wang L, Liu X, et al. Deep Sequencing of Maize Small RNAs Reveals a Diverse Set of MicroRNA in Dry and Imbibed Seeds [J]. PloS one, 2013.

[2]Yang X, Wang L, Yuan D, et al. Small RNA and degradome sequencing reveal complex miRNA regulation during cotton somatic embryogenesis [J]. Journal of experimental botany, 2013.

 

一级a做爰片_免费视频在线观看2017 <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <文本链> <文本链> <文本链> <文本链> <文本链> <文本链>